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Monday, January 25, 2021

Estimation of C. elegans cell- and tissue volumes

MicroPubl Biol. 2021 Jan 4;2021:10.17912/micropub.biology.000345.

Jonathan J Froehlich, Nikolaus Rajewsky and Collin Y Ewald.

電顕写真から、C.エレガンス成虫の各組織・細胞の体積を見積もった。組織は大きい順に、腸、下皮(最近は上皮と呼ばれる)、生殖腺、体壁筋、咽頭、神経系。最大の細胞は下皮のhyp7で、2番めに大きな細胞の10倍以上。チューリッヒ工科大学のEwaldなど。2021年。

https://www.micropublication.org/journals/biology/micropub-biology-000345/

Tuesday, January 5, 2021

Small RNAs couple embryonic developmental programs to gut microbes

bioRxiv  

Hayao Ohno, Zhirong Bao.

線虫が納豆菌などの難消化性微生物を経験すると、子の胚発生様式が変わる(腸細胞が増え、発生が一部左右非対称になる)。RNAiやマイクロRNAがエピジェネティック制御に関与。スローンケタリング研究所のBao研。2020年プレプリント。

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.13.381830v1


「C. elegans雌雄同体の体細胞は959個」という記述も線虫を説明するときによく見られるが(いまや高校生向けの教材にも載っているんだとか)、これは環境中に難消化性微生物が存在しない場合に限られる?


(追記)

「C. elegans雌雄同体の体細胞は959個」などと言うときの細胞数のカウントは他にも少し難しいところがあって、例えば細胞融合により多核細胞(一つの細胞に複数の核がある)となる表皮(下皮とも言う)の細胞については、細胞でなく「細胞核」の数を数えている。

では体細胞ではなく「体細胞核」の数が959個という記述(実際によく見られる)が正しいのかというと、細胞分裂を伴わない核分裂(binucleation)によりL1幼虫期に多核化する腸細胞では細胞核でなく細胞の数を数えているので、実はこれも完全に正確ではないはず。

というわけで、「C. elegansの体細胞数は雌雄同体で959個、雄は1031個」

という記述は、現時点で正確に言うなら、

「C. elegansの体細胞数は、細胞融合による細胞数減少をカウントせず、難消化性微生物が環境中に存在しない場合に限り、雌雄同体で959個、雄は1033個(MCM含む)」

とでもなるだろうか。


Glia-derived neurons are required for sex-specific learning in C. elegans

 Nature. 2015 Oct 15;526(7573):385-390.  

Michele Sammut, Steven J Cook, Ken C Q Nguyen, Terry Felton, David H Hall, Scott W Emmons, Richard J Poole, Arantza Barrios 

線虫の雄が持つMCMという左右一対の神経を新しく発見。MCMはAMsoグリアが分裂して生み出され、この神経が異性の存在と塩化ナトリウムを関連づける連合学習に寄与。UCLのBarrios研など。2015年。

https://www.nature.com/articles/nature15700


C. elegansの雄の体細胞数を「1031個」とする記述が現在でも見られるが、MCM神経の発見により細胞数が2つ増えたので、「1033個」がより正しい。

Monday, December 7, 2020

Post-embryonic cell lineages of the nematode, Caenorhabditis elegans;
The postembryonic cell lineages of the hermaphrodite and male gonads in Caenorhabditis elegans;
The embryonic cell lineage of the nematode Caenorhabditis elegans

Dev Biol. 1977 Mar;56(1):110-56.

J E Sulston, H R Horvitz.


Dev Biol. 1979 Jun;70(2):396-417.

J Kimble, D Hirsh.


Dev Biol. 1983 Nov;100(1):64-119.  

J E Sulston, E Schierenberg, J G White, J N Thomson.


C. elegansの受精卵が成虫になるまでの細胞分裂や細胞死のパターン(細胞系譜)を全て記述。ほぼ完全に不変で個体差のない発生過程をたどる。SulstonやKimbleら。Sulstonは2002年にノーベル賞を受賞。1977・1979・1983年。

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/0012160677901580

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/0012160679900356

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/0012160683902014

Connectomes across development reveal principles of brain maturation in C. elegans

bioRxiv.

Daniel Witvliet et al.

C. elegans雌雄同体の神経の数は「302個」とされてきたが、「CANL・CANR細胞は実は神経ではない」と主張する動きが去年あたり(?)から目立つ(シナプスの欠如や遺伝子発現パターンなどが理由)。すでに線虫雌雄同体の神経数を「302個」ではなく「300個」とする論文も出てきていて、今後の動きを注視したい。トロント大学Zhen研など。2020年プレプリント。

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.30.066209v1.full


全く科学の本質と離れた意見だが、神経数を「300個」に減らす問題点は、「だいたい」300個、という誤った印象を持たれやすいこと?

「302個」なら正確に数えたことが明らかなのだが。

いずれにしろ、現時点でどちらかの数字を説明なく使うのは危険!

The structure of the nervous system of the nematode Caenorhabditis elegans

Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 1986 Nov 12;314(1165):1-340.  

J G White, E Southgate, J N Thomson, S Brenner

電子顕微鏡の連続切片写真から、C. elegansの神経の位置・形態やシナプス接続(7000個以上)をほとんど完全に記述した340ページの超大作。別名「The mind of a worm」。J. G. WhiteらがBrennerのもとで完成。1986年。

The mind of a worm


線虫オスの尾部について全神経接続を記述した論文も後に報告された。アルバート・アインシュタイン医科大のEmmons研など。2012年。

https://science.sciencemag.org/content/337/6093/437


これまで不確実だった部分も含めて、雄と雌雄同体の全神経接続を新しく記述し直した論文も後に報告された。これもEmmons研など。2019年。

https://www.nature.com/articles/s41586-019-1352-7