An Abundant Class of Non-coding DNA Can Prevent Stochastic Gene Silencing in the C. elegans Germline

Cell. 2016 Jul 14;166(2):343-357.  

Christian Frøkjær-Jensen, Nimit Jain, Loren Hansen, M Wayne Davis, Yongbin Li, Di Zhao, Karine Rebora, Jonathan R M Millet, Xiao Liu, Stuart K Kim, Denis Dupuy, Erik M Jorgensen, Andrew Z Fire 

前々投稿に続き生殖腺でのサイレンシングのルールの報告。連続したAもしくは連続したTが約10塩基ごとに周期的に並ぶような配列（PATC）が非翻訳領域にある場合に、遺伝子がサイレンシングを逃れて発現する。Frøkjær-Jensenら。2016年。

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867416306766

外来遺伝子を生殖腺もしくは初期胚で高発現させたい場合は、PATCを多く含むイントロン（smu-1遺伝子のイントロンなど）を入れれば、安定して発現しやすくなる（前々投稿のpiRNAの論文でも使用）。

https://science.sciencemag.org/content/359/6375/587

（12月9日追記）

PATCを多く含むイントロンの挿入など様々な方法を組み合わせて、外来遺伝子を生殖腺で（ゲノムに挿入せずに）簡単に安定発現させる方法の報告。KAUST（サウジアラビア）のFrøkjær-Jensen研。2020年12月9日。

https://www.nature.com/articles/s41467-020-19898-0

pirScan: a webserver to predict piRNA targeting sites and to avoid transgene silencing in C. elegans

Nucleic Acids Res. 2018 Jul 2;46(W1):W43-W48.

Wei-Sheng Wu, Wei-Che Huang, Jordan S Brown, Donglei Zhang, Xiaoyan Song, Hao Chen, Shikui Tu, Zhiping Weng, Heng-Chi Lee.

遺伝子中のpiRNA標的配列を予測して、piRNAによるサイレンシングを受けない配列に変えることができるウェブツールの「pirScan」の報告。これもシカゴ大学Lee研。2018年。

https://academic.oup.com/nar/article/46/W1/W43/4979435

The piRNA targeting rules and the resistance to piRNA silencing in endogenous genes

Science. 2018 Feb 2;359(6375):587-592.

Donglei Zhang, Shikui Tu, Michael Stubna, Wei-Sheng Wu, Wei-Che Huang, Zhiping Weng, Heng-Chi Lee.

piRNAが生殖腺で標的遺伝子の発現を抑制する際の配列の法則の報告。piRNA標的配列の使用を避ければ、生殖腺で外来遺伝子を発現させやすくできる。例えばCas9を高発現させてゲノム編集の効率を上げられる。シカゴ大学Lee研。2018年。

https://science.sciencemag.org/content/359/6375/587